葡萄克隆出现浅色果皮,是否都能解释成“丢掉了同一段DNA”?Pelsy等于2015年4月2日发表的Pinot研究,没有把这类变化归入一个统一过程。作者比较Pinot noir、Pinot gris与Pinot blanc的33个克隆,并进一步解析其中九个克隆的L2细胞层单倍型。全部材料的数量与深入解析的数量不同,后面的分子解释也来自明确的比较范围。

论文用“着色”和“白色”区分所比较的单倍型背景,所指是与花青素合成有关的遗传状态,并非DNA本身具有肉眼颜色。作者报告,至少六种单倍型能够解释花青素生物合成能力的丧失。其中四种涉及着色单倍型的部分区段,被同源的白色单倍型区段替换。这里讨论的是对应片段的信息关系,不是把整个染色体都换成另一种染色体。

缺失又是另一项具体观察。摘要说,相关序列间的信息转移使第二染色体部分区域趋于纯合,其中一例还伴随较大的缺失。因此,“有片段替换”与“有一段不存在”可以出现在同一研究中,甚至共同进入某个病例的说明。若只留下一个“删除”,就会抹去作者解析到的同源区段替换;若只留下“替换”,也会漏掉伴随的缺失。

分子变化发生在哪一层细胞,同样影响解释。论文指出,所讨论的体细胞变化多数并非同时影响整株的全部组织,而是集中在一个细胞层,形成结合两种基因型的周缘嵌合体。Pinot gris的背景尤其具体:表皮L1仍有着色能力,下表皮L2则具有阻止花青素合成的变化。看到一种整体果色,还不能因此为每层细胞填上相同状态。

两份自然芽变材料又提供了另一种联系。研究将两个Pinot gris克隆与各自的浅绿黄色芽变相比较,并检查亲本茎髓这一L2来源组织。浅色芽变的基因型与亲本茎髓相同,作者据此支持下表皮白色细胞占据表皮着色细胞位置的解释。此处的证据同时涉及芽变、亲本内部组织和细胞层来源,超出了只按果色深浅分类。

但这两个芽变的具体分子路线仍有未定部分。结果和讨论都保留:同源区段替换可以解释所见基因型,较大缺失的可能性仍不能排除。本文因此不在两者中擅选唯一答案,也不把作者提出的细胞层重排过程写成所有白色Pinot克隆都已经逐一验证的共同祖源。

这项研究为葡萄变异资料留下两条需要接合的证据:一条是染色体片段发生了怎样的变化,另一条是变化位于哪层细胞、后来怎样体现在芽变中。本文采用原论文连续摘要、结果和讨论中的这些记录,未读取图像或给出遗传实验、繁殖、苗木鉴定及酿酒品质结论。浅色是研究的起点,而非替全部分子与细胞过程作答的终点。

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